Python3元编程技巧

本文参考David Beazley 13年pycon的演讲整理. 大师写了35年的程序, 依然对新技术保持高度热情, 走在技术的最前面. 甚至现在好多年轻人都执着于...

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基于MongoDB和Flask的变异信息数据库

本文讲述如何将VCF文件通过MongoDB建立数据库服务,并且利用flask搭建简单的web平台,提供用户接口。

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[翻译]LiftOver

原文链接: http://genome.sph.umich.edu/wiki/LiftOver;lift over是指在不同参考基因组版本之间互相转换位置的过程。

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clinvar数据库的使用

clinvar数据库记录基因组变异和人类健康的关系, 在遗传变异与疾病的研究中非常重要, 本文将讲述clinvar数据库的下载、注释过程,以及常用工具在注释clinvar数据库时存在的问题

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[翻译]Variant Normalization

原文链接: http://genome.sph.umich.edu/wiki/Variant_Normalization; 当发生MNP或者INDEL等变异时,变异表示往往有多种形式,本文讲述如何将变异表示进行标准化处理、如何快速检查某个变异是否是标准化,以及推演过程。

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使用wkhtmltopdf

wkhtmltopdf是一个将html转换成PDF文件的工具

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第一个生物信息app

本文讲述一个简单的pyqt桌面应用建立过程,以及如何在应用中使用数据库服务。

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Linux文件下载方式汇总

本文介绍几种常见的linux环境下文件下载方式,并对支持的协议、断点续传、多线程等进行比较

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Python3标准库_collections

命名元组namedtuple

命名元组顾名思义就是有名称的元组, 其本质是一个继承自tuple的对象, 使用namedtuple函数可以快速创建该对象的子类, 并具有一些常用的方法, 设置verbose=True可以看到子类的细节;

```python from c...

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规模化爬取NCBI

本文讲述如何使用爬虫技术,通过rs号来自动获取NCBI中的信息,并介绍如何并行使用爬虫工具。

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